Roche lance le séquenceur de gènes Axelios pour défier la mainmise d'Illumina à 70 %

Le nouveau séquenceur de gènes de Roche peut effectuer une analyse complète du génome en une seule journée, menaçant la domination vieille de plusieurs décennies d'Illumina dans le séquençage de l'ADN.

Roche a lancé lundi le séquenceur de gènes AXELIOS 1, un défi direct à la mainmise d'Illumina à 70 % sur le marché du séquençage génétique, valorisé à 7,3 milliards de dollars. Le géant suisse du diagnostic vise à installer 100 unités dès sa première année et à générer plus d'un milliard de francs suisses de revenus annuels grâce à cette plateforme.

« AXELIOS 1 offrira une solution de séquençage disruptive qui combine une haute précision avec une rapidité et une évolutivité inégalées », a déclaré Matt Sause, directeur général de Roche Diagnostics, dans un communiqué. « À l'avenir, AXELIOS 1 possède le même potentiel pour permettre la prochaine génération d'applications cliniques et ouvrir de nouvelles frontières dans la médecine personnalisée. »

La plateforme utilise la technologie de séquençage par expansion (SBX), une approche novatrice qui convertit l'ADN en polymères de substitution appelés Xpandomères — 50 fois plus longs que la molécule d'origine — et les lit via un capteur réutilisable à semi-conducteur complémentaire en oxyde métallique contenant des millions de nanopores. Le système peut produire des résultats de génome entier en quelques heures, avec des lectures allant jusqu'à 1 500 paires de bases, et traiter à la fois des études à petite échelle et de grands projets génomiques sur un seul instrument. Roche s'est associée à 10x Genomics pour des kits d'application monocellulaire et spatiale, et a intégré Google DeepVariant pour l'analyse de base, aux côtés d'une suite bioinformatique open source appelée XOOS.

Ce lancement intervient plus d'une décennie après la tentative avortée de rachat d'Illumina par Roche pour 6,8 milliards de dollars en 2016. Illumina, qui détient environ 70 % de la base installée de séquenceurs génétiques, fait face à une concurrence croissante du fabricant chinois MGI Tech et de nouveaux entrants comme Pacific Biosciences. L'entrée en scène de Roche ajoute un rival bien capitalisé, doté d'un réseau commercial de diagnostic existant couvrant plus de 150 pays.

Fonctionnement de la technologie SBX

La chimie SBX encode la séquence d'une molécule d'acide nucléique cible en un polymère de substitution mesurable doté de rapporteurs à rapport signal/bruit élevé, améliorant la précision du séquençage à molécule unique. Le module capteur CMOS de la plateforme est réutilisable et conçu pour un séquençage rentable à différentes échelles de projet. Les utilisateurs en accès précoce ont démontré des applications en oncologie, génétique et maladies infectieuses, et la technologie a établi un record mondial pour la technique de séquençage d'ADN la plus rapide, selon Roche. L'entreprise propose des kits de préparation de bibliothèques ainsi que la suite d'analyse XOOS gratuite. De multiples applications de recherche ont été testées comme preuve de concept depuis le dévoilement de la technologie SBX début 2025, notamment le séquençage du génome entier, le séquençage d'ARN, l'ARN monocellulaire, l'analyse spatiale et la détection de méthylation.

Les enjeux pour Illumina et les investisseurs

Les revenus de séquençage d'Illumina ont totalisé 4,5 milliards de dollars en 2025, et les marges brutes de l'entreprise subissent des pressions en raison des instruments moins chers de MGI. L'AXELIOS 1 de Roche, avec son délai d'exécution d'un jour et son débit flexible, pourrait accélérer la compression des prix dans le segment de la recherche avant de potentiellement pénétrer le diagnostic clinique — un marché où Illumina réalise l'essentiel de ses bénéfices. Roche a obtenu des soutiens de Broad Clinical Labs et de la Hartwig Medical Foundation, avec des livraisons commerciales initiales en cours vers les États-Unis, le Royaume-Uni, l'Allemagne et la France. Le marché du séquençage devrait croître à des taux à deux chiffres, selon DeciBio, laissant de la place pour plusieurs acteurs, mais l'envergure de Roche et sa capacité de vente croisée en font une menace plus redoutable que des concurrents plus modestes. Les actions Roche se négocient à environ 17 fois les bénéfices à terme ; toute contribution significative aux revenus de l'AXELIOS 1 est peu probable avant 2027, selon les analystes.

Cet article est fourni à titre d'information uniquement et ne constitue pas un conseil en investissement.